Molecular phylogeny is the use of the structure of molecules to gain information on an organism's evolutionary relationships. The result of a molecular phylogenetic analysis is expressed in a so-called
phylogenetic tree.Every living
organism contains
DNA,
RNA, and
proteins. Closely related organisms generally have a high degree of agreement in the
molecular structure of these substances, while the
molecules of organisms distantly related usually show a pattern of dissimilarity. Molecular phylogeny uses such data to build a "relationship tree" that shows the probable
evolution of various organisms. Not until recent decades, however, has it been possible to isolate and identify these molecular structures.
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分子系統学（ぶんしけいとうがく）とは、
系統学の一方法であり、
生物のもつ
タンパク質の
アミノ酸配列や
遺伝子の
塩基配列を比較することにより、生物が
進化してきた道筋（系統）を推定する（つまり
系統樹を作成する）方法である。従来の系統学は形態、発生、化学・生化学的性質といった
表現型の比較に基づいていたのに対し、分子系統学はそれらの根本にある
遺伝子型に基づく方法であり、より直接的に生物の進化を推定できると期待される。計算機や理論の発達に加え、20世紀末に遺伝子解析が容易になったことから大いに発展し、進化生物学の重要な柱となっている。
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