Kjønnsorganer er de deler av en organisme som inngår i forplantning. De er spesialiserte organer eller organsystemer for kjønnet formering. Både planter og dyr kan ha spesialiserte forplantningsorganer.

Kjønnsorgan er kroppsdelar som blir brukte til kjønna formeiring. Det finst ytre kjønnsorgan som overfører eller tek imot kjønnsceller, og indre kjønnsorgan som lagar og sender ut slike celler og eventuelt tek vare på embryoet.