Bakterier är encelliga mikroorganismer utan cellkärna och andra organeller. Bakterier räknas till prokaryoterna som även inkluderar domänen arkéer. Bakterier är vanligtvis ett antal mikrometer långa och väger ett antal hundra femtogram. Bakterier kan ha ett varierande utseende, bland annat formade som sfärer, spiraler (helix) eller stavar.

• Actinobacteria
• Aquificae
• Chlamydia
• Bacteroidetes/Chlorobi
• Chloroflexi
• Chrysiogenetes
• Cyanobacteria
• Deferribacteres
• Deinococcus-Thermus
• Dictyoglomi
• Fibrobacteres/Acidobacteria
• Firmicutes
• Fusobacteria
• Gemmatimonadetes
• Lentisphaerae
• Nitrospirae
• Planctomycetes
• Proteobacteria
• Spirochaetes
• Thermodesulfobacterium
• Thermomicrobia
• Thermotogae
• Verrucomicrobia

Bakterier (Græsk: baktérion for 'småstav') er mikroskopiske organismer, som består af en cellemembran, cytoplasma og DNA. Bakterier er prokaryoter og har således ingen cellekerne. Der findes både ufarlige og patogene bakterier, og de kan opdeles i to typer baseret på opbygningen af deres cellevæg - grampositive og gramnegative (en vigtig faktor, for hvilke antibiotika, man kan behandle de patogene med)