Po I wojnie światowej rejon Malmedy i pobliskiego Eupen miał być miejscem plebiscytu dotyczącego oderwania tego obszaru od Niemiec i włączenia go do Belgii. Mieszkańcy, obawiając się deportacji do Rzeszy wybrali przynależność do Belgii. Aneksja nastąpiła 6 marca 1925 roku.

W 1944 roku, podczas ofensywy w Ardenach, w Malmedy miała miejsce masakra alianckich jeńców wojennych. Wtedy to 84 amerykanów zostało zabitych przez oddział Waffen SS LSAH. Co więcej dnia 23, 24 i 25 grudnia 1944 roku miasto zostało zbombardowane przez Siły Powietrzne Armii Stanów Zjednoczonych, pomimo iż miasto znajdowało się pod kontrolą wojsk amerykańskich. Ataki te spowodowały śmierć około 200 cywilów, a liczba ofiar wśród amerykańskich żołnierzy nigdy nie została podana do publicznej wiadomości.