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Linkage disequilibrium

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Linkage disequilibrium
In population genetics, linkage disequilibrium is the non-random association of alleles at two or more loci, that descend from single, ancestral chromosomes. Linkage disequilibrium is wholly a measurement of proximal genomic space. It is necessary to refer to this as gametic phase disequilibrium or simply gametic disequilibrium because it is described through DNA recombination. In other words, linkage disequilibrium is the occurrence of some combinations of alleles or genetic markers in a population more often or less often than would be expected from a random formation of haplotypes from alleles based on their frequencies. It is a second order phenomenon derived from linkage, which is the presence of two or more loci on a chromosome with limited recombination between them. The amount of linkage disequilibrium depends on the difference between observed allelic frequencies and those expected from a homogenous, randomly distributed model. Populations where combinations of alleles or genotypes can be found in the expected proportions are said to be in linkage equilibrium.

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Desequilibrio de ligamiento
En genética se denomina desequilibrio del ligamiento a la propiedad de algunos genes de las poblaciones genéticas de no segregar de forma independiente, esto es, poseen una frecuencia de recombinación menor del 50%. Esto suele deberse a que los dos loci implicados se encuentran en el mismo cromosoma, lo que imposibilita su transferencia a la progenie de manera aleatoria con la separación de los cromosomas en anafase.

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Linkage disequilibrium
Il linkage disequilibrium (LD) è un termine dell'ambito genetico che indica la presenza di associazione statistica tra specifici alleli relativi a due o più loci, che costituiscono di solito un particolare aplotipo ancestrale, diffuso nella popolazione in cui è rilevato perché trasmesso lungo la discendenza da un comune progenitore. Per questo motivo il linkage disequilibrium è maggiore in popolazioni omogenee, cioè originate da un nucleo di individui fondatori come le popolazioni sarda o finlandese. Infatti le migrazioni recenti generano substruttura ed eterogeneità genetica e aplotipi differenti associati allo stesso tratto tendono ad abbassare i valori di significatività.

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連鎖不平衡
連鎖不平衡(れんさふへいこう、、略称LD)とは生物の集団において、複数の遺伝子座の対立遺伝子または遺伝的マーカー(多型)の間にランダムでない相関が見られる、すなわちそれらの特定の組合せ(ハプロタイプ)の頻度が有意に高くなる集団遺伝学的な現象をいう。それらは一般には同じ染色体上にあって遺伝的連鎖をしているが、連鎖していても連鎖不平衡が見られない場合もあり、また例外的に別の染色体上で見られる場合もある。つまり遺伝的連鎖とは別の(連鎖している場合も含む)現象である。

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Linkage disequilibrium
Em genética populacional, linkage disequilibrium (desequilíbrio de ligação) é a associação não-aleatória de alelos em dois ou mais loci , não necessariamente no mesmo cromossoma. Não é a mesma coisa que linkage, que descreve a associação de dois ou mais loci num cromossoma com recombinação limitada entre eles. O linkage desequilibrium descreve uma situação em que algumas combinações de alelos ou marcadores genéticos ocorrem mais ou menos frequentemente numa população do que era esperado pela formação aleatória de haplótipos a partir de alelos baseados nas suas frequências. Associações não-aleatórias entre polimorfismos am loci diferentes são medidos pelo grau de linkage desequilibrium.

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