Zwykle dzieli się na fizjologię zwierząt i roślin. Jednak w miarę rozwoju nauki pojawiły się badania dotyczące węższych grup organizmów lub specjalizacje np. w ramach konkretnych narządów a nawet funkcji i tak możemy wyróżnić:

• fizjologię drobnoustrojów
• elektrofizjologię
• fizjologię komórek (cytofizjologia)
• fizjologię mowy
• fizjologię patologiczną (patofizjologia)
• fizjologię roślin (fitofizjologia)
• fizjologię układu nerwowego (neurofizjologia)
• fizjologię zwierząt w tym:
• fizjologię człowieka