Rodzice Eddiego rozwiedli się, gdy był niemowlęciem. Wkrótce po tym jego matka wyszła ponownie za mąż. Ma on trzech młodszych braci. W 1974 r. rodzina przeprowadziła się do San Diego i wtedy zaczęły się kłopoty Eddiego. W 1981 r. rodzice postanowili wrócić do Chicago, natomiast Eddie, którego coraz bardziej interesowała muzyka, został w San Diego. Rok później dowiedział się, że człowiek, którego uważał za ojca, był jego ojczymem. Pewnego dnia poznał Jacka Ironsa. W 1990 r. Irons przyniósł kasetę z utworami nagranymi przez znajomych na poddaszu domu Stone'a Gossarda w Seattle. Zauroczony ich muzyką Eddie nagrał wokale do ich kawałków i odesłał do Seattle. Gossard, Jeff Ament, Mike McCready i Dave Krusen stali się jego przyjaciółmi, z którymi założył zespół Mookie Blaylock. W 1991 r. podpisali kontrakt z wytwórnią Epic i zmienili nazwę na Pearl Jam, a 28 sierpnia wydali swój pierwszy album "Ten".