Als Darmflora wird die Gesamtheit der
Mikroorganismen bezeichnet, die den
Darm des Menschen wie von Tieren besiedelt und auch für den Wirtsorganismus von entscheidender Bedeutung ist - es herrscht somit ein
Mutualismus. Die an und für sich inkorrekte Bezeichnung „
Flora“ beruht auf der früher vertretenen Auffassung, Bakterien und viele andere Mikroorganismen gehörten zum
Pflanzenreich. Da Bakterien heute eine eigene
Domäne bilden, müsste man richtigerweise von einer „Darmmikroorganismengemeinschaft“ oder „-gesellschaft“ bzw. von einer Darmmikrobiota sprechen – Bezeichnungen, die sich in der Medizin - auch international - erst langsam durchsetzen.
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