DNA-binding proteins are proteins that are composed of DNA-binding domains and thus have a specific or general affinity for either single or double stranded DNA. Sequence-specific DNA-binding proteins generally interact with the major groove of B-DNA, because it exposes more functional groups that identify a base pair. However there are some known minor groove DNA-binding ligands such as Netropsin, Distamycin, Hoechst 33258, Pentamidine and others.

Białka wiążące DNA to szeroka klasa białek posiadających motywy strukturalne pozwalające im na wiązanie się do dwu- lub jednoniciowego DNA. Przykładem takich białek  mogą być: czynniki transkrypcyjne, których funkcją jest regulacja ekspresji genów, polimerazy zależne od kwasów nukleinowych, zaangażowane w replikację DNA i transkrypcję na mRNA.

Con il nome di DNA-binding protein (dall'inglese proteina legante l'DNA, spesso abbreviato a DNAbp) si intende una proteina in grado di instaurare legami con il DNA.