生物学における塩基配列(えんきはいれつ)とは、
DNA、
RNAなどの
核酸において、それを構成している
ヌクレオチドの結合順を、ヌクレオチドの一部をなす有機塩基類の種類に注目して記述する方法、あるいは記述したもののこと。DNAは、物質として
遺伝情報を保持している本体であるが、この情報は塩基配列の形になっている。例えば、DNAの塩基配列の情報は、
コドンの形で、細胞が作り出す
蛋白質を決定している他、特定の蛋白質が、DNAのうちのある決まった塩基配列部分にだけ結合することで
遺伝子発現を左右する現象などが広く知られている。また、細胞の分裂の際や生殖による子孫となる個体の形成時には、塩基配列がそれらに伝わることが、形質の保持や遺伝という現象を支えているといえる。したがって、核酸の塩基配列を調べることは、遺伝情報の解析の上で非常に基本的な作業である。
ゲノムプロジェクトはある
生物の
ゲノムの全塩基配列の読み取りを目標としている。
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