Ærøskøbing, dansk stad, centralort i Ærø kommun i Danmark. Orten ligger på ön Ærø och har 982 invånare (2009). De äldsta nämnda privilegierna är från Kung Hans I:s tid, men orten tros vara något äldre. Stadsrättigheterna är från 1522. Orten har ett välbevarat centrum med hus från 1700-talet. Många av husen och gatorna i Ærøskøbing är från medeltiden.